Структуру органов местного самоуправления Киндальского сельского поселения составляют:
- представительный орган муниципального образования — Совет Киндальского сельского поселения Каргасокского района Томской области;
- глава муниципального образования — Глава Киндальского сельского поселения Каргасокского района Томской области;
- исполнительно-распорядительный орган муниципального образования — Муниципальное казённое учреждение «Администрация Киндальского сельского поселения» Каргасокского района Томской области.
